El Instituto Nacional Cornelio Azenón Sierra, inicia operaciones académico - educativas  por el año de 1952 bajo la tutela de la Alcaldía Municipal; funciono  en la Escuela Urbana Mixta General Francisco Menéndez, siendo director el Profesor  Héctor Gustavo  Lopez;  posteriormente quedo en manos del Profesor Guido y luego por el Profesor Oporta. En ese entonces el Instituto Nacional Cornelio Azenón Sierra, era conocido con el nombre de: Instituto Autorizado de Educación Media. Tiempo después fue trasladado a una casa particular propiedad de Don Julio Rosendo Castro.

En la administración del gobierno de El Salvador del General Fidel Sánchez Hernández; siendo ministro y vice ministro de educación el Doctor Walter Béneke y el historiador Gilberto Aguilar Avilés, se construyó la infraestructura principal del Instituto Nacional, en un terreno comprado a iniciativa y esfuerzo del Profesor José Anibal Vega Retana, en coordinación con la comunidad Atiquizayense. Lugar que ocupa actualmente, desde aquella época.

En la década de los 80 la infraestructura ya no era suficiente, pues la demanda de la población estudiantil se incremento notablemente; a razón de lo anterior se inician las gestiones a través de: El departamento de Infraestructura del Ministerio de Educación Región Occidental, y se construyen cuatro aulas y un taller para las prácticas de Electrotecnia.

Después de la crisis nacional que se presento en los años ochentas e inicios de la década del noventa, estuvieron a cargo de la dirección los profesores y licenciados: Victor Francisco Pérez López y José Arnulfo Rodríguez Arias. La  dirección del centro escolar, seguidamente pasa a manos del Profesor Carlos Alberto Acevedo Martínez; administración durante la cual se construyen dos aulas y una bodega para electrotecnia.

Entre los años de 1996 y 1997 se da la legalización del nombre actual del centro escolar: Instituto Nacional Cornelio Azenón Sierra, en honor al maestro y erudito Atiquizayense que prestó sus servicios a la institución.

Durante los años de 1996 al 2002 la administración y dirección del centro académico, estuvo nuevamente a cargo del Profesor y Licenciado José Arnulfo Rodríguez Arias, quien amplio la infraestructura de la institución. Construyendo dos aulas más y edificando el 75% del tapial de la cancha de fútbol.  Se introducen al currículo académico de los estudiantes las clases en el área de informática; concencionadas a una empresa privada dedicada a la capacitación académica informática; ya que el centro escolar no contaba con equipamiento informático para el uso de los alumnos/as en aquella época. Además de la inserción del Instituto Nacional al proyecto APREMAT; nacido bajo el seno del MINED y de la Unión Europea.

Para el periodo 2002 al 2005, la dirección del Instituto Nacional Cornelio Azenón Sierra pasa a manos del Profesor Roni Alexander Góchez; director comprometido directamente con la calidad de la educación media técnica y general. Durante este periodo se introduce el primer centro de cómputo con veinte y dos equipos, al servicio de la materia de informática que reciben los estudiantes. Además se consolida la implementación del proyecto APREMAT, el cual consiste en realizar la implementación de equipo tecnológico de vanguardia para el área de electrotecnia (Automatismo, Instalaciones Eléctricas Residenciales, Motores y otros) . Equipamiento que es utilizado por  los estudiantes y docentes de esta área. A través de APREMAT se consolidan capacitaciones a docentes en diversas áreas y temáticas.

El 3 de Mayo del año 2003 se da el nacimiento del Centro de Recursos para El Aprendizaje CRA, proyecto nacido y administrado bajo el seno del MINED y la dirección del centro escolar. Proyecto que busca reforzar y potenciar el Proceso de Enseñanza Aprendizaje de los estudiantes, a través del uso e implementación de las Tecnologías de Información y Comunicación por parte del personal docente, dentro del aula.


En el periodo 2005 a la fecha la conducción académica administrativa, recae nuevamente en las manos del profesor Roni Alexander Góchez; en este periodo la población estudiantil del instituto crece considerablemente en un 12% anualmente y se renueva un 80% de todo el mobiliario áulico brindado a los estudiantes (pupitres y mesas). Se construye una cisterna que provee de agua a la infraestructura del centro escolar, con fondos provenientes de los padres – madres de familia a través del servicio social estudiantil y fondos propios administrados por el Consejo Directivo Escolar. Además en el año del 2008 se adquieren veinte equipos de cómputo para el área general y en el año 2009 se adquieren catorce equipos más, para el área anteriormente mencionada. Se amplia considerablemente el area de servicios sanitarios para los estudiantes, construyendo un módulo de 7 sanitarios más para atender a la creciente demanda estudiantil.

Actualmente se está llevando a cabo el proyecto de mejoramiento de la cancha de fútbol soccer, mediante la implementación de un sistema de riego y engramillado para está área deportiva. Y la reciente compra de este dominio educativo (incas.edu.sv).